Некоторые мои каталоги практически целиком выпали из индекса поисковой машины Яндекс. Возможно, причина тому большое количество недоброкачественного содержания, но, все же, мне кажется, что дело в фильтре... новом фильтре Яндекса, который блокирует каталоги по каким-то критериям.

Одним из таких критериев может быть следующий: если сайт содержит большое количество контента, повторяющегося на других сайтах без его значительного изменения (большое количество нечетких дублей, некий аналог "Supplemental results"), наиболее вероятно, сайт является каталогом, каталогом мусорным, не содержащим дополнительной полезной информационной нагрузки... и его следует блокировать.

Также, возможно, учитывается показатель вИЦ, и, если часть каталога (определенные страницы) имеет большое количество входящих ссылок (например: главная страница, популярные сайты каталога) , то эта часть останется в индексе. А все остальное - мусор. Именно поэтому в индексе могут оставаться некоторые страницы каталога.

И в этом есть рациональное зерно. Нужно думать, нужно думать как контент каталога сделать более полезным и менее "мусорным".